Stephanos Konstantinidis a des activités de recherche dans le domaine des matériaux. Il encadre plusieurs doctorants effectuant des recherches dans le cadre de la synthèse de films minces fonctionnels par l'intermédiaire de procédés basés sur l'utilisation de plasmas froids. La recherche menée vise a contribuer à une meilleure compréhension de l'interaction du plasma avec les surfaces afin de pouvoir contrôler finement les propriétés physico-chimiques des surfaces traitées.